Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms