Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.9 ms