Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms