Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms