Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEFVO15553 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MEFVO15553 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEFVO15553 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEFVO15553 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms