Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms