Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CUX2O14529 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CUX2O14529 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUX2O14529 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUX2O14529 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUX2O14529 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms