Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms