Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E9PBE3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E9PBE3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E9PBE3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E9PBE3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms