Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf58C9J3I9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms