Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A8MVJ9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A8MVJ9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A8MVJ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A8MVJ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A8MVJ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A8MVJ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms