Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms