Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms