Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms