Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PQD8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms