Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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