Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL1

ST20-MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms