Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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