Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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DUSP4Q13115 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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DUSP4Q13115 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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DUSP4Q13115 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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DUSP4Q13115 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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