Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEX5L-201ENST00000263962 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006330.1-201ENST00000624598 1987 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRF1-204ENST00000393230 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ICOS-202ENST00000435193 2528 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 MUC21-202ENST00000486149 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CWH43-204ENST00000513409 2390 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFSF14-201ENST00000245912 4336 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GBP2-201ENST00000370466 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 BSND-201ENST00000371265 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHTF8P1-201ENST00000414660 1541 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUNX1T1-204ENST00000422361 2450 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUPT7L-204ENST00000406540 2869 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD9B-205ENST00000409425 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL021877.1-201ENST00000457251 2194 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR61-207ENST00000618721 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRX-202ENST00000539067 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPATCH4-201ENST00000368232 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASS4-201ENST00000360314 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAX6-243ENST00000638903 2620 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.7 ms