Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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