Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms