Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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