Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TRPM1-201ENST00000256552 5514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CORO2A-201ENST00000343933 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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