Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRZ1P23471 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms