Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC003080.1-201ENST00000413552 767 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC009806.1-201ENST00000526112 519 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CD300LF-208ENST00000581500 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BNIP3P15-201ENST00000604600 301 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC02391-201ENST00000615716 800 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MAN1A2P1-201ENST00000590286 1400 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NLRP3-201ENST00000336119 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC00486-201ENST00000414054 1794 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF35-201ENST00000296092 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CREM-207ENST00000356917 1895 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 JAKMIP2-202ENST00000333010 2992 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CPNE4-210ENST00000512332 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 NELL1-203ENST00000357134 3022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SSR1-203ENST00000462112 1094 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC044787.1-201ENST00000497325 792 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNA5SP459-201ENST00000516628 100 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms