Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SAR1B-201ENST00000402673 6682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms