Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ERCC6Q03468 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ERCC6Q03468 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms