Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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