Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 STAT6-201ENST00000300134 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MCTP1-205ENST00000505208 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MOV10L1-210ENST00000545383 3889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AP001120.1-201ENST00000561598 3710 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL353132.1-201ENST00000415260 2043 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC117529.1-201ENST00000505789 2023 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 NBPF4-201ENST00000415641 2485 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MAP3K19-202ENST00000375844 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL592158.1-201ENST00000632210 4477 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 C16orf62-205ENST00000513947 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TNFSF11-204ENST00000405262 2135 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 S100A13-201ENST00000339556 514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 OR2L6P-201ENST00000416377 940 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MTND6P21-201ENST00000443620 482 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CPVL-203ENST00000409850 2213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ESCO2-201ENST00000305188 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 NLRP12-204ENST00000391773 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms