Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC004828.1-201ENST00000555303 654 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC01588-211ENST00000556434 892 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SHBG-209ENST00000572182 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MIR3150B-201ENST00000580142 86 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC008875.1-201ENST00000607715 811 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PPARGC1A-218ENST00000617484 1026 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 CSF2RA-209ENST00000432318 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC00607-205ENST00000445174 3690 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL117192.1-202ENST00000557689 1990 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 STYK1-201ENST00000075503 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC01120-201ENST00000437751 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZNF726-201ENST00000322487 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 KCNS3-202ENST00000403915 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SEC31B-201ENST00000370345 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SUN5-201ENST00000356173 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ECM2-201ENST00000344604 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SLC12A8-201ENST00000393469 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SMARCAL1-202ENST00000358207 3056 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC005005.3-201ENST00000609017 1410 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC021054.1-201ENST00000537514 2338 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AGBL4-202ENST00000371836 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FLT1-206ENST00000615611 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MARCH1-214ENST00000514618 3903 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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