Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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GABPAQ06546 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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GABPAQ06546 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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GABPAQ06546 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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GABPAQ06546 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GABPAQ06546 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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