Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms