Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 LINC00710-219ENST00000635054 938 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CUBNP1-201ENST00000412710 1790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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BCL11BQ9C0K0 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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BCL11BQ9C0K0 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 MAPK10-240ENST00000639175 2596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
BCL11BQ9C0K0 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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