Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP52-201ENST00000352665 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 HDC-202ENST00000543581 2180 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 DYRK4-211ENST00000540757 3272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CNOT4-212ENST00000541284 3563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP8B5P-204ENST00000439972 2522 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 C2orf42-201ENST00000264434 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM124B-202ENST00000389874 2594 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ARMC8-201ENST00000358441 3181 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC022034.2-201ENST00000426023 2387 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 L3MBTL3-204ENST00000526019 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms