Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN11AQ9UI33 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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