Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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COPS7AQ9UBW8 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COPS7AQ9UBW8 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COPS7AQ9UBW8 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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