Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DOPEY2-202ENST00000399151 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC00654-201ENST00000379053 6113 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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