Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PRKCHP24723 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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