Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms