Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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