Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S4R3C0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S4R3C0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S4R3C0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
S4R3C0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms