Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms