Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP3Q9Y6F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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