Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms