Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms