Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVW-1Q9UQF0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms