Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP1Q9UPQ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms