Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L1RE1Q9UN81 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms