Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms